Los restos humanos más antiguos hallados en Huánuco datan de entre los años 8000 a 10 000 a. C. Alrededor del 2500 a. C., se formó el imperio de los yarohuilcas, quienes más adelante serían anexados al Tahuantinsuyo. Es ahí donde comienza la historia de la contabilidad en la zona.

Por aquel entonces, lo que hoy conocemos como Huánuco era, principalmente, una serie de caminos que conectaban Cusco con Cajamarca. El traslado de productos de una ciudad a otra, así como por todo el imperio, requería de un método para llevar correctamente la contabilidad. Ese método fueron los khipus.

Estos consistían en unas soguillas de colores con las que nuestros antepasados se comunicaban y cuyos nudos representaban cantidades. Servían para el control de la población, la posesión de tierras y el trabajo, tal como detalla Viviana Ruth Moscovich en su libro El khipu y la yupana (2016).   

Estas soguillas quedarían en desuso con la llegada de los españoles, quienes introducirían la contabilidad europea, cuya base, por esa época, eran las ideas de Luca Pacioli en torno a la partida doble. Del mismo modo, se comienzan a aplicar impuestos como el almojarifazgo, el diezmo y la alcabala.